Garvicin KS GakB 2098351 - 25 - 6

2025-02-27ASPCMS社区 - fjmyhfvclm

基本信息

  • 英文名称:Garvicin KS、GakB
  • 中文名称:Garvicin KS 暂译为加维菌素 KS ,GakB 尚无标准通用中文译名
  • 氨基酸序列:GakB 为 MGAI IKAGAKIIGKGL LGGAAGGA TYGGLK KIFG ,Garvicin KS 由 GakA、GakB 和 GakC 三种小肽组成 ,GakA 序列为 MGAI IKAGAKIVGKGVLGGGASWLGWNVGEKIWK ,GakC 序列为 MGAI IKAGAKIVGKALTGGG VWLA EKLFGGK
  • 单字母序列: MGAI IKAGAKIIGKGL LGGAAGGA TYGGLK KIFG
  • 三字母序列:
  • GakB:Met - Gly - Ala - Ile - Ile - Lys - Ala - Gly - Ala - Lys - Ile - Ile - Gly - Lys - Gly - Val - Leu - Gly - Gly - Gly - Ala - Gly - Gly - Ala - Thr - Tyr - Gly - Gly - Lys - Lys - Ile - Phe - Gly
  • 分子量:GakB 约 3161.08
  • 分子式:GakB 为 C₁₄₅H₂₄₇N₃₉O₃₇S
  • CAS 号:2098351 - 25 - 6
  • 供应商:上海楚肽生物科技有限公司

结构信息

Garvicin KS 是一种多肽细菌素,由三个大小在 32 - 34 个氨基酸之间的相似小肽构成。GakB 是其中一个 34 氨基酸肽,与 GakA、GakC 通过特定的氨基酸排列顺序和相互作用,形成具有特定空间构象和功能的细菌素结构。这些小肽之间可能通过氢键、疏水相互作用等维持整体结构的稳定性,这种稳定结构对其发挥抗菌等生物学活性至关重要。

作用机理及研究进展

  • 作用机理:Garvicin KS 具有抗菌活性,可能通过与敏感菌细胞膜上特定受体结合,在细胞膜上形成孔道,导致细胞内重要物质如离子、氨基酸等外泄,破坏细胞正常生理功能,抑制细菌生长甚至导致细菌死亡。GakB 在其中可能参与 Garvicin KS 的合成、分泌、转运或者作用过程。例如,它可能参与 Garvicin KS 的加工修饰,使其具备活性;或者辅助 Garvicin KS 识别并结合到靶细胞上,增强 Garvicin KS 的抗菌效果。研究发现 GakB 和 GakA 组合具有良好的肽稳定性、抗菌效力,同时还会影响成纤维细胞的活力和增殖 ,对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的抑制效果中,GakB 的最小抑菌浓度(MIC)值相对较低,抑制效果较好。
  • 研究进展:目前研究主要集中在 Garvicin KS 的抗菌活性及应用潜力探索,发现它对许多致病性革兰氏阳性细菌,如李斯特菌、肠球菌、芽孢杆菌和葡萄球菌等具有强大活性,在食品保鲜、医疗抗菌等领域展现出潜在应用价值。关于 GakB,研究主要围绕它与 Garvicin KS 其他组分的协同作用及在相关生物学过程中的功能,但具体分子机制仍有待深入研究。

溶解保存

  • 粉末保存:应将其置于干燥环境,避免受潮,-20℃条件下可保存 3 年。
  • 溶液保存:建议在 - 80℃保存,保存时需注意分装,避免反复冻融。若多肽中含有易氧化的氨基酸,如 Cys(半胱氨酸)、Met(甲硫氨酸)等,应保存在无氧环境中,以维持多肽的稳定性和活性。如果需要溶解,可先尝试用无菌去离子水,若溶解性不佳,也可使用少量二甲基亚砜(DMSO)助溶,但要留意 DMSO 在最终使用浓度下对生物活性的影响。

相关多肽

  • Nisin(乳酸链球菌素):也是一种细菌素,常用于食品保鲜,能抑制革兰氏阳性菌生长,与 Garvicin KS 在抗菌功能上有相似之处,但抗菌谱和作用机制存在差异。
  • Enterocin(肠球菌素):由肠球菌产生的细菌素,有抗菌活性,与 Garvicin KS 同属细菌素类多肽,在结构和功能上或许存在关联和共性,研究它有助于深入理解细菌素的作用机制和应用潜力。

相关文献

  • Thapa RK, Winther - Larsen HC, Diep DB, Tønnesen HH. Preformulation studies on novel Garvicin KS peptides for topical applications. European Journal of Pharmaceutical Sciences. 2025; 151: 105333.
  • Telke AA, Ovchinnikov KV, Vuori Sto KS, Mathiesen G, Thorstensen T, Diep DB. Over 2000 - fold increased production of the leaderless bacteriocin Garvicin KS by increasing gene dose and optimization of culture conditions. Frontiers in Microbiology. 2019; 10: 389.
  • Ovchinnikov KV, Chi H, Mehmeti I, Holo H, Nes IF, Diep DB. Novel group of leaderless multi peptide bacteriocins from gram - positive bacteria. Applied and Environmental Microbiology. 2016; 82(17): 5216 - 24.

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