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补牙不会直接感染衣原体，但存在潜在的感染风险。

虽然补牙过程中通常不涉及与生殖系统相关的疾病，但在使用未经严格消毒的医疗器械时，可能存在微小的风险将其他致病微生物引入口腔，其中包括衣原体。因此，在进行任何医疗程序之前，确保所用器械的安全性至关重要。

在极少数情况下，如果使用的填充材料或工具受到污染，则可能有间接接触传播的风险。

为了预防感染，建议在接受补牙等口腔治疗前告知医生是否存在免疫缺陷或其他易感因素，并遵循医嘱采取必要的防护措施。